Berdasarkan Peraturan Rektor ITB No. 011/PR/I1.A/PP/2020p, kurikulum program magister berbasis riset terdiri dari 24-48% matakuliah terstruktur dan 52-75% matakuliah mandiri. Ada 2 jenis matakuliah terstruktur yaitu matakuliah regular untuk mengembangkan wawasan dan kompetensi keilmuan yang diselenggarakan secara terstruktur (tatap muka) dan matakuliah metodologi penelitian yang bertujuan untuk mengembangkan kompetensi khusus metodologi penelitian yang diselenggarakan dengan pembelajaran terstruktur. Adapun matakuliah mandiri terdiri dari matakuliah pelaksanaan penelitian untuk mengeksekusi pelaksanaan riset yang dilaksanakan mandiri oleh peserta dengan bimbingan. Program ini harus diselesaikan dalam kurun waktu 1,5 tahun dan maksimal 3 tahun.
